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2018年遼寧大學(xué)研究生考試851生物信息學(xué)考試大綱公布如下
遼寧大學(xué)
全國(guó)碩士研究生招生考試自命題科目考試大綱
考試科目: 生物信息學(xué)
一、考試形式和試卷結(jié)構(gòu)
(一)試卷滿分及考試時(shí)間
本試卷滿分為 150 分,考試時(shí)間為 180 分鐘。
(二)試卷題型結(jié)構(gòu)及分值比例
名詞解釋?zhuān)s30分);簡(jiǎn)答題(約40分);問(wèn)答題(約50分);論述題(約30分)。
二、考查內(nèi)容
1.生物信息學(xué)相關(guān)概念、主要研究方向、相關(guān)發(fā)展簡(jiǎn)史、相關(guān)重要事件及發(fā)展趨勢(shì)。
2.生物信息學(xué)中常用生物數(shù)據(jù)(核酸序列數(shù)據(jù)、蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù))的測(cè)定方法,常用的數(shù)據(jù)庫(kù)序列數(shù)據(jù)存儲(chǔ)格式。
3.重要的生物信息學(xué)網(wǎng)站,重要數(shù)據(jù)庫(kù)的使用方法,主要包括核酸數(shù)據(jù)庫(kù)、基因組數(shù)據(jù)庫(kù)、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)。生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的相關(guān)概念。
4.遺傳密碼與蛋白合成概念、方法,開(kāi)放閱讀框的預(yù)測(cè)方法,真核生物基因預(yù)測(cè)與外顯子識(shí)別關(guān)系的方法,基因序列的注釋方法。
5.序列比對(duì)的概念,掌握一致性、相似性、同源性的概念及其之間的區(qū)別,常用的序列比對(duì)算法和軟件,常見(jiàn)打分矩陣和空位罰分體系。
6.序列數(shù)據(jù)庫(kù)搜索工具BLAST,各種BLAST結(jié)果的含義, BLAST算法的原理及NCBI BLAST各參數(shù)的含義。
7.系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)相關(guān)概念,使用MEGA等軟件構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)的方法,三種常見(jiàn)的進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建算法(近鄰法、最大簡(jiǎn)約法、最大似然法)的概念、原理、方法。
8.蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的組成和層次,序列相似性與結(jié)構(gòu)相似性同蛋白質(zhì)分類(lèi)之間的關(guān)系,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類(lèi)及相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)。蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的可視化的概念和方法。
9.蛋白質(zhì)家族、蛋白質(zhì)信號(hào)及其表示方式,主要包括一致序列、序列模式、多序列聯(lián)配無(wú)空位片段、序列譜以及相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù),主要包括Prosite、PRINTS、Pfam等數(shù)據(jù)庫(kù)。
10.蛋白質(zhì)序列分析與功能的預(yù)測(cè)方法,主要包括理化性質(zhì)、跨膜螺旋、信號(hào)肽、翻譯后修飾、亞細(xì)胞定位等。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)常用方法,包括二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)。
11.基因和蛋白質(zhì)芯片的概念、原理及其主要應(yīng)用。
12.數(shù)據(jù)挖掘與機(jī)器學(xué)習(xí)的概念,常見(jiàn)機(jī)器學(xué)習(xí)算法。
13.基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)的概念、方法。
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