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《生物信息學(xué)》考試大綱
一、基本要求
掌握生物信息學(xué)常用數(shù)據(jù)庫和使用方法;掌握序列比對方法和主要比對軟件使用方法;掌握DNA序列和蛋白質(zhì)序列特征分析和常用序列分析軟件包使用方法;掌握分子進(jìn)化理論和常用分析方法;掌握基因功能注釋方法和常用軟件使用方法;掌握基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析方法和常用分析軟件使用方法。
二、考試范圍
1. 課程相關(guān)知識
基本要求:掌握生物信息學(xué)的定義、基本概念和發(fā)展;掌握生物信息學(xué)研究的基本內(nèi)容、基本原理和生物學(xué)基礎(chǔ);了解計算機(jī)在生物研究中的應(yīng)用;了解生物信息學(xué)發(fā)展史、開發(fā)與產(chǎn)業(yè)化。
1.生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫
(1)知識點(diǎn)1:NCBI數(shù)據(jù)庫的介紹
(2)知識點(diǎn)2:Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫
(3)知識點(diǎn)3:PDB數(shù)據(jù)庫
基本要求: 掌握NCBI數(shù)據(jù)庫的建設(shè)和使用方法;掌握Swiss-Prot和PDB數(shù)據(jù)庫的使用方法。
2.序列比對
(1)知識點(diǎn)1:雙重序列比對分析
(2)知識點(diǎn)2:多序列比對分析
(3)知識點(diǎn)3:BLAST數(shù)據(jù)庫搜索
基本要求:掌握序列比對的原理和方法;掌握如何使用BLAST軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)庫搜索和同源性分析。
3.序列特征分析
(1)知識點(diǎn)1:DNA序列特征分析
(2)知識點(diǎn)2:蛋白質(zhì)序列特征分析
基本要求:掌握基因預(yù)測的原理和方法;掌握啟動子區(qū)域預(yù)測和分析的原理和方法;掌握蛋白質(zhì)序列跨膜區(qū)分析的原理和方法。
4.分子進(jìn)化分析
(1)知識點(diǎn)1:系統(tǒng)發(fā)育樹的概念
(2)知識點(diǎn)2:分子進(jìn)化理論
(3)知識點(diǎn)3:系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
基本要求:掌握系統(tǒng)發(fā)育樹的概念;掌握DNA和蛋白質(zhì)序列適應(yīng)性進(jìn)化的分子理論;掌握系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建的原理和方法。
5. 基因功能注釋
(1)知識點(diǎn)1:基因功能的基本概念
(2)知識點(diǎn)2:基因功能的注釋原理和方法
基本要求:掌握基因注釋和功能分類的基本概念;掌握基因功能注釋的原理和方法;掌握常用基因功能注釋軟件的使用;
6.基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析
(1)知識點(diǎn)1:基因表達(dá)數(shù)據(jù)獲取的生物學(xué)技術(shù)平臺
(2)知識點(diǎn)2:基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析
基本要求:掌握基因表達(dá)技術(shù)的主要生物學(xué)平臺;掌握基因表達(dá)數(shù)據(jù)的主要分析方法和原理;掌握基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析常用軟件的使用。
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